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      數(shù)據(jù)、算法、好基友:智能算法如何突破醫(yī)藥研發(fā)

      本文作者: AI科技評論 2016-05-10 10:24
      導語:兩位同名、同姓、志同道合的創(chuàng)始人,除了有一家奇葩的醫(yī)藥公司,還有一個奇葩的相遇故事。

      數(shù)據(jù)、算法、好基友:智能算法如何突破醫(yī)藥研發(fā) Andre M. Radin(左)和Andrew A. Radin(右),同名同姓的巧合讓他們走到了一起。圖片:AndrewRadin.com

      醫(yī)藥研究員多年來一直使用計算機幫助他們開發(fā)新藥,例如用來建立分子模型或分析醫(yī)療記錄。這讓研究員們可以提出藥物治療的新想法,有時候,一下子就有幾千個新想法。研究員然后制造并測試藥物——現(xiàn)在培養(yǎng)皿,然后用動物,然后,如果藥物試驗結果一路都不錯,就在人類身上測試。這個過程有可能得花十年時間、甚至更久,同時花費數(shù)十億美元,這意味著要治療癌癥、糖尿病和帕金森,依然是路漫漫其修遠。

      位于美國加州Palo Alto的創(chuàng)業(yè)公司twoXAR希望通過讓智能算法來測試海量的備選藥物,來縮短這條漫長之路。公司創(chuàng)始人的背景是計算機科學,而非醫(yī)藥研究,他們說自己有得天獨厚的能力來實現(xiàn)人工智能藥物。

      “我們來看看汽車行業(yè),”twoXAR創(chuàng)始人及CEO Andrew Radin說,“如果你叫一個汽車工程師來讓汽車變得更安全,他會提出安裝安全第一、氣囊、防鎖剎車等等裝置。但是如果你讓軟件工程師來干,他會說‘我們把司機換掉吧’。無人車并不是GM或者福特公司最早提出的。

      “計算機可以實現(xiàn)很多,”twoXAR聯(lián)合創(chuàng)始人及公司首席商務官Adnrew Radin說,“但是他們通常是為研究員的工作帶來補充。在進行藥物研發(fā)的人們是生命科學家、化學家、分子生物學家;他們建造分子模型,然后決定測試哪些模型,而不是讓計算機來處理數(shù)據(jù)然后決定哪些模型可以進一步研究。”

      眼尖的你也許已經注意到了上文的奇怪之處,提示:就在兩位公司創(chuàng)始人的職位介紹旁邊。沒有打錯字哦,兩位創(chuàng)始人就是同名同姓:都叫Andrew Radin。實際上公司名字twoXAR的意思就是“Andrew Radin乘以二”。兩位Andrew:CEO Andrew A. Radin和CBO Andrew M. Radin——互相認識的方式也像他們的藥物開發(fā)新方法一樣奇葩。

      數(shù)據(jù)、算法、好基友:智能算法如何突破醫(yī)藥研發(fā)

      圖片來源:IEEE Spectrum

      同名同姓的巧合

      十年前,Andrew A.收購了網(wǎng)絡域名AndrewRadin.com。2008年,Andrew A.收到了一位名叫Andrew M的陌生人的郵件,希望收購該域名。“我說不,泥奏凱,然后他一直說你不用的話就賣給我嘛。我最后不得不簡單粗暴地甩掉他。”

      當時,Andrew A.已經從羅切斯特理工學院獲得了計算機科學本科和碩士學位,已經在硅谷住了一段時間,在創(chuàng)業(yè)公司工作,同時也建立自己的創(chuàng)業(yè)項目。Andrew M從加州大學圣地亞哥分校獲得了生物化學和細胞生物學的本科學位,同時也有一個經濟學雙學位,他當時在投資銀行工作,正考慮攻讀MBA。

      大約一年后,Andrew M.想惡搞一下,在Facebook上建立了一個Andrew Radin粉絲群;全國有幾位Andrew Radin都加了群,Andrew A.也是其中之一。因此兩位同名同姓的人在社交媒體上又相遇了,雖然Andrew A.一直將Andrew M.視作想買下自己域名的“壞銀”。

      2010年,Andrew A.在中國旅游了一個月,在Facebook上發(fā)了個圖。他回國幾個月后,Andrew M.去中國學習了六個月中文,在Facebook上給他發(fā)了消息問能不能給他一些在中國旅游的建議。結果,兩人在電話上聊了幾個小時。Andrew A.回憶說:”就是那時候他在我腦海里的印象改變了,不是個‘壞銀’。“

      兩位主角的下一次對話是3年后。Andrew A.在斯坦福攻讀生物信息學,而Andew M.是MIT的研究生。

      “我的一個MIT同學要去硅谷做一次學習訪問,”Andrew M.說,“所以我聯(lián)系了Andrew A.,請他坐下聊聊他的創(chuàng)業(yè)經歷;這是我們第一次面對面見面。”

      從此,兩位Andrew成為了好朋友。而twoXAR的成立則是另一則故事。

      Andrew A.在Nortel Networks和America Online分別參與了軟件開發(fā)工作,但后來加入了硅谷的創(chuàng)業(yè)大軍,從2004年到2013年,他在“各種不同行業(yè)”創(chuàng)業(yè)公司作為CTO,據(jù)他回憶其中包括了“打電話的、做電子游戲的、做廣告的還有做地圖的。“沒有一家是獨角獸公司,"雖然地圖公司Locationary被蘋果收購,此次收購讓他獲得了足夠的經濟收益,可以一段時間不用工作。

      2013年的時候,他不再想?yún)⑴c技術上挺有趣、但是產品不夠震撼力的項目,而是想做一些有意義的事情。最初,他考慮了流浪漢的問題,但是他的妻子鼓勵他做些別的,“讓你的技能可以發(fā)揮影響的事情。“他最終選擇了生物化學信息學,也就是,利用計算機科學來解決醫(yī)學問題。他感覺自己需要回到學校來學習更多關于該領域的知識,他參與了斯坦福的項目。

      與此同時,比Andew A.小13歲的Andrew M.一直心里癢癢想要創(chuàng)業(yè)。他說:”我的目標一直是開一家生物科技公司。我在高中的時候在做遺傳工程,選擇了加州大學圣迭戈分校是因為學校誕生了很多生物科技創(chuàng)業(yè)公司;我主修了生物化學和經濟學。”Andrew M的第一份工作是一家專注在科技投資領域的銀行;然后他加入了MIT斯隆商學院攻讀研究生,注重創(chuàng)業(yè)領域。

      因此,2014年兩位Andrew又多了一個共同點:他們都在讀研究生。

      數(shù)據(jù)、算法、好基友:智能算法如何突破醫(yī)藥研發(fā)

      圖片來源:AndrewRadin.com

      寫論文,還是寫專利?

      在斯坦福,Andrew A上了一門課BMI217,作業(yè)是提出一個可以用計算機解決的醫(yī)學問題。他想出了一種方法,利用數(shù)據(jù)科學來發(fā)現(xiàn)新藥。最終,這個想法演變成一算法,用來整合、分析各個獨立的生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫,來預測什么藥物最可能在某種疾病療法的測試中成功。數(shù)據(jù)庫包括但不限于醫(yī)療記錄搜索(分析使用某種疾病的人的醫(yī)療記錄,來看是否有某種別的疾病水平異常低,意味著治療有效)、分子相似度模型(關注已經在使用中的藥物,試圖發(fā)現(xiàn)其他具有類似結構的物質)以及基因表達信息(研究某種基因特征,將其與已知分子進行匹配)。

      它其實是一種工具,可以在巨大的、獨立的數(shù)據(jù)庫之間比較聯(lián)系,從噪音中分離出信號。”他說。該技術可以結合不限數(shù)量的公開及專利數(shù)據(jù)庫,將某種藥物質量某種疾病的成功率進行排名。

      最初,他只打算簡簡單單寫篇論文。然后他與V. Paul Lee一起吃午飯,lee是Electronic Arts的前總裁,曾在Andrew A的一些創(chuàng)業(yè)項目中投資。“Paul用‘你個蠢貨’的眼神看著我并說:‘如果你寫個論文,結果什么也不會實現(xiàn)不了;如果你想實現(xiàn)點什么,你不該寫論文,而是寫個專利申請,然后建立一家公司。”

      因此,他就花了幾個月琢磨這個問題:寫論文還是寫專利?他與Andrew M.在電話聊天,考慮了自己困境,咨詢Andrew M基于該技術能不能建造一家公司。Andrew A回憶道:“他告訴我來波士頓,和MIT的教授們討論一下。”他在2014年6月真的去了。

      教授們幫兩位Andrew看清了道路,這的確可以成為一個商業(yè)機會。他們在MIT的某次查爾士河泛舟活動上,最終決定了創(chuàng)立twoXAR公司。7月,Andrew M搬來了硅谷——暫時與Andrew A夫婦住在一起。

      如今,twoXAR有了10名員工、430萬風險投資和一間棒棒的辦公室。他們還在招聘,希望到年底增加幾位數(shù)據(jù)科學與生物信息科學的關鍵員工。

      公司在研究院和生物醫(yī)藥公司利用現(xiàn)有藥物測試了他們的預測算法,用算法處理數(shù)據(jù)庫,看看算法得出的優(yōu)選藥物名單中是否有這些現(xiàn)有的藥物。目前,他們已經用超過40種疾病進行了評估,包括癌癥、自動免疫疾病和神經紊亂疾病。基于這些測試,他們?yōu)樽畛醯墓ぷ鞫ㄏ滤膫€領域,公司還未對外公布。在這些領域內,他們已經進行了藥物預測,開始在動物中測試化合物。此刻,兩位Andrew還沒計劃將算法賣給醫(yī)藥公司;他們認為,醫(yī)藥公司的內部文化已經根深蒂固,對于利用計算機算法來驅動決策會保持懷疑態(tài)度。他們努力打造自己的藥物產品線,通常與研究機構一起合作。

      他們稱公司已經與學術界和商業(yè)機構簽訂了一些合作項目,但是只有一項目前是公開的。twoXAR上個月宣布與斯坦福大學醫(yī)學院的皮膚病系合作,識別針對淋巴系統(tǒng)疾病、單純型大皰性表皮松解(EBS)和其他罕見疾病的藥物。

      Andew A說,現(xiàn)在“有很好的機會,來為疾病找到更加精確的藥物,無論是流行疾病還是罕見疾病,有可能現(xiàn)有治療方法不夠有效,或者現(xiàn)在尚未有治療方法。目前,藥物研發(fā)還是違反摩爾定律的——要發(fā)現(xiàn)新藥從算法上來說越來越難,成本越來越高。

      TwoXAR想要改變這一局面。

      如果你還記得N年以前關于在線域名的那檔子事——兩個Andrew有了一個共同網(wǎng)站:AndrewRadin.com。

      via IEEE Spectrum

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